董孔軍 (1979年1月— )，男，漢族，甘肅省甘谷縣人，中共黨員，研究員。

2001年畢業(yè)于甘肅農(nóng)業(yè)大學(xué)農(nóng)學(xué)院農(nóng)學(xué)專業(yè)，同年分配到甘肅省農(nóng)業(yè)科學(xué)院糧食作物研究所工作，歷任研究實(shí)習(xí)員、助理研究員，2013年晉升為副研究員。

參加完成的“高蛋白豐產(chǎn)谷子品種隴谷10號”，獲2007年甘肅省科技進(jìn)步三等獎；參加完成的“適宜救災(zāi)的早熟豐產(chǎn)糜子新品種隴糜8號”，獲2008年甘肅省科技進(jìn)步三等獎；參加完成的“優(yōu)質(zhì)高產(chǎn)糜子品種隴糜7號選育與應(yīng)用”，獲2010年甘肅省科技進(jìn)步三等獎；參加完成的“抗除草劑谷子新品種隴谷11號”，獲2013年甘肅省科技進(jìn)步二等獎；主持完成的“優(yōu)質(zhì)廣適豐產(chǎn)糜子品種選育與應(yīng)用”，獲2016年度甘肅省科技進(jìn)步二等獎。

發(fā)表的論文有《西北旱作區(qū)不同地膜覆蓋種植方式對谷子生長發(fā)育的影響》、《不同生育階段灌水處理對谷子生長發(fā)育的調(diào)控效應(yīng)》、《糜子育成品種苗期抗旱性評價與鑒定指標(biāo)篩選》等。

2017年獲得中國作物學(xué)會“青年科技獎”。